La enfermedad puede causar pérdidas económicas en los cebaderos a consecuencia de la mortalidad, los costes de tratamiento o los efectos en la productividad. El impacto de la enfermedad clínica y subclínica sobre la eficacia productiva y la recuperación económica puede ser mayor que las pérdidas asociadas con la mortalidad. Es esencial una profunda comprensión del impacto de la enfermedad sobre la producción animal y de la importancia de las pérdidas económicas para hacer recomendaciones rentables a los gerentes de los cebaderos. Los costes asociados con pérdidas por muerte de animales, con animales enfermos crónicos que se comercializan prematuramente a bajo precio y con los tratamientos son obvios y fáciles de calcular. Los costes ocultos, como menor rendimiento y menor calidad de la canal, son a menudo menos evidentes.
Los costes de tratamiento son otra fuente de pérdida económica. Los factores que influyen en el coste medio incluyen la tasa de morbilidad, tasa de tratamientos repetidos, coste de los fármacos, combinación frente a tratamiento antibiótico simple, si se requiere tratamiento complementario, la mano de obra y el margen de beneficio de los productos utilizados. La tasa de morbilidad tiene la mayor influencia sobre el coste medio de tratamiento de todo el ganado en el corral. Cuando se emplea metafilaxis para manejar enfermedades del tracto respiratorio bovino, se debe añadir al coste total de medicamentos del rebaño.