A veces se observan quistes subepiglóticos en la parte posterior de la faringe y el paladar blando. Son una causa poco frecuente de ruido respiratorio en los caballos jóvenes. Aunque suelen estar presentes desde el nacimiento, a menudo pasan desapercibidos hasta que el caballo empieza a hacer ejercicio. Los signos incluyen ruido respiratorio e intolerancia al ejercicio. Los quistes grandes pueden producir tos, dificultad para tragar e inhalación de materiales extraños en los potros. La afección se diagnostica mediante un examen endoscópico de las vías respiratorias superiores. El tratamiento implica la extirpación completa del revestimiento del quiste. La rotura del quiste lo "desinfla" temporalmente, pero la recidiva es frecuente.
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