La lesión de los músculos es probablemente la causa más frecuente de dolor dorsolumbar en el caballo. Esto afecta más comúnmente al músculo longissimus dorsi, que actúa para extender y flexionar lateralmente la columna vertebral. La distensión de todos o parte de los músculos largos suele producirse durante el ejercicio con jinete, y los signos clínicos se asocian con alteración de la actividad y dolor dorsolumbar agudo o crónico. Los puntos principales de lesión son la cruz caudal y las regiones lumbares craneales (inmediatamente delante y detrás del área de la montura). La mayoría de estas lesiones responden a periodos de descanso y fisioterapia, aunque se pueden necesitar varias semanas para la recuperación total. Las anomalías de la musculatura toracolumbar también se observan con frecuencia en la rabdomiólisis de esfuerzo (síndrome de inmovilización, ver Miopatías por esfuerzo en caballos).