El funcionamiento saludable de una protectora de animales requiere que la instalación mantenga un ambiente higiénico. La prevención de la transmisión de enfermedades mediante técnicas de limpieza y desinfección adecuadas es mucho más fácil y más rentable que tratar un brote de enfermedad. Los veterinarios pueden ayudar a las protectoras de animales a desarrollar protocolos de limpieza y desinfección que sean eficientes y eficaces.
Los protocolos de limpieza y desinfección deben equilibrar los beneficios de supresión de la enfermedad de los procesos de desinfección con el impacto negativo de los procedimientos excesivamente entusiastas que causan un estrés innecesario a los animales de la protectora y contribuyen a la expresión de la enfermedad. Es apropiado tener protocolos separados para limpiar las zonas comunes, ordenar y limpiar los recintos primarios mientras están ocupados por el mismo animal o animales, desinfectar las jaulas entre los ocupantes de los animales e implementar procedimientos de limpieza y desinfección profunda en el caso de un brote de enfermedad.
Un recinto primario puede mantenerse en un estado ordenado durante la ocupación continua y permanente de un animal o grupo cerrado de animales. Hacerlo reduce el estrés de ser sacado del recinto para ser devuelto a uno donde los olores familiares del ocupante han sido reemplazados por el olor a limpieza y desinfección. El orden también se conoce como limpieza por puntos, la eliminación y reposición de la cama sucia, la eliminación de los desechos visibles recogiendo las heces y barriendo suavemente la basura o las croquetas derramadas, y la reposición de alimentos y agua. Cuando se limpia la jaula, es apropiado recoger las heces con una aplicación concentrada de una solución de limpieza para eliminar cualquier residuo. Cuando un animal es adoptado o abandona el recinto principal, el recinto debe someterse a una higiene completa.
La higienización es el proceso de limpieza del entorno de la perrera para reducir la presencia de microorganismos infecciosos por debajo del umbral de transmisión de la enfermedad (con el objetivo de eliminar la presencia de una "dosis infecciosa"). La higiene se logra mediante un proceso de cuatro pasos: limpieza, lavado, desinfección y secado. Dado que la higienización implica la aplicación de productos químicos y el rociado con mangueras, los animales siempre deben ser retirados de los recintos durante este proceso.
El aseo, o limpieza en seco, es como la limpieza localizada, descrita anteriormente, pero a mayor escala. Todos los materiales se retiran del recinto y todos los desechos y materiales orgánicos se limpian o barren. Cuando se limpia una protectora para animales, se debe hacer todo lo posible para minimizar la creación de nubes de polvo. Este objetivo se puede lograr usando escurridores de goma en lugar de escobas y bajando las bandejas de basura profundamente en el recipiente de basura antes de volcarlas con cuidado. Este paso de limpieza reduce la difusión de material orgánico que favorece la persistencia de agentes infecciosos.
Después de eliminar todos los materiales visibles, puede comenzar el lavado (fregado con detergente). El lavado se realiza mejor aplicando el detergente con una espuma de baja presión usando agua caliente y luego frotando con un cepillo de cerdas. El aplicador de espuma ayuda a la aplicación en superficies verticales y elevadas. En espacios más pequeños, donde los espumantes no son apropiados, se puede usar una botella que produzca un chorro de detergente diluido. El fregado con detergente rompe las biopelículas que pueden impedir la penetración de desinfectantes. El fregado debe realizarse de arriba hacia abajo, prestando especial atención a las grietas, esquinas y barras de la jaula, donde los desechos pueden acumularse. Después de fregar, el detergente debe enjuagarse con una manguera de baja presión o limpiarse con un chorro de agua y toallas de papel. Debe evitarse el enjuague a alta presión porque aerosoliza bacterias y virus que todavía no han sido inactivados por el desinfectante. Deben evitarse los cubos y los trapos porque pueden ser fómites, objetos inanimados capaces de transferir un agente infeccioso de un lugar a otro. Mientras se lavan las jaulas, toda la ropa retirada, los juguetes, los platos y las bandejas también se pueden lavar y desinfectar. El paso de lavado elimina hasta el 99 % de las bacterias presentes y prepara las superficies para la desinfección.
La desinfección implica diluir el desinfectante de acuerdo con la etiqueta del fabricante y permitir que el desinfectante permanezca en contacto con la superficie durante el tiempo prescrito. La selección del desinfectante debe basarse en los agentes infecciosos a los que se dirige y en la seguridad del producto para las especies alojadas. La lejía es un desinfectante económico que es eficaz frente a bacterias, parvovirus y virus respiratorios en una dilución 1:32 (0,5 taza/3 L) y frente a las esporas de la tiña en una dilución 1:10 (1,5 tazas/3 L) con un tiempo de exposición en húmedo de 10 minutos. Las limitaciones de la lejía son que es cáustica, corrosiva y un irritante respiratorio que debe diluirse diariamente. Otras opciones para la desinfección incluyen productos de amonio cuaternario, agentes oxidantes, biguanidas y fenoles. Cada una de estas categorías de desinfectantes tiene sus propios beneficios y limitaciones. Los veterinarios deben trabajar con las protectoras de animales para adaptar la elección de desinfectantes al tipo más útil, rentable y eficaz para el entorno y la población de un refugio en particular.
El secado debe hacerse si hay humedad residual después del periodo especificado de exposición a la desinfección húmeda. El secado debe estar completo antes de que los animales sean devueltos a un recinto. Después del periodo de desinfección especificado, el secado al aire puede acelerarse mediante el uso de toallas de papel o una escobilla de goma. Los ventiladores pueden expulsar humos respiratorios irritantes alrededor de la protectora y no se recomiendan universalmente; sin embargo, pueden ser apropiados en algunos entornos. Los animales devueltos a recintos que todavía están mojados con desinfectante pueden desarrollar úlceras en las almohadillas de las patas o entre ellas, en el escroto, en la lengua o alrededor de la boca. Algunos desinfectantes deben enjuagarse después del periodo de desinfección especificado para que los animales puedan volver a ocupar el espacio, por lo que es esencial una cuidadosa selección y uso del desinfectante.