Se ha descrito una infección por virus de la viruela aviar en una gran cantidad de especies de aves silvestres y de compañía. Las cepas aisladas en algunos casos son solo infecciosas para la especie que sirve de hospedador, mientras que en otros casos son infecciosas para una o más especies diferentes. A falta de información genética sobre la mayoría de estos virus, la clasificación suele basarse en la patogenicidad del hospedador o en estudios de protección cruzada. Se ha determinado la secuencia de nucleótidos del genoma del virus de la viruela del canario. La viruela del canario suele ser grave, y la mortalidad se aproxima a veces al 100 %. Pueden desarrollarse lesiones cutáneas, así como una infección generalizada con cuerpos de inclusión citoplasmáticos, que se detectan en las lesiones durante el examen histológico. La vacuna comercial para canarios estuvo disponible en EE. UU. durante algún tiempo. La infección de las psitácidas ocasionada por poxvirus puede ser grave, especialmente en la amazona frentiazul. Los poxvirus aislados de psitácidas parecen ser antigénicamente diferentes de los virus de la viruela de otras especies de aves. Véase también la información sobre infección por viruela aviar en pollos y pavos.
Los perfiles genómicos de los virus de la viruela del canario, de la viruela del miná y de la viruela de la codorniz muestran marcadas diferencias con el virus de la viruela aviar cuando se compara su ADN mediante polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción tras la digestión con endonucleasas de restricción. El virus de la viruela de la codorniz tiene diferencias antigénicas notables con el virus de la viruela aviar, y aunque existen antígenos de reacción cruzada, estos ofrecen una protección limitada o nula contra el virus de la viruela aviar.
En Hawái, la infección por un poxvirus aviar se ha considerado como un factor limitante de las poblaciones de aves de bosque en peligro de extinción. Los poxvirus aviares aislados en cuervos hawaianos (Corvus hawaiiansis), gansos de Hawái (Branta sandvicensis), palilas (Loxiodes bailleui) e Himatione sanguinea son diferentes entre sí y del virus de la viruela aviar. Asimismo, un poxvirus aislado en un cóndor andino (Vultur gryphus) en el zoo de San Diego es antigénicamente, genéticamente y biológicamente distinto del virus de la viruela aviar. Estos virus tienen un tamaño genómico mayor que el del virus de la viruela aviar y muestran más similitud genética con el virus de la viruela del canario que con el virus de la viruela aviar. Al igual que el virus de la viruela aviar, estos virus parecen ser vectores adecuados para la expresión de genes extraños hacia el desarrollo de vacunas virales genéticamente modificadas para especies de mamíferos. Existen varias vacunas vectorizadas con el virus de la viruela del canario que expresan genes de patógenos de mamíferos y que están disponibles en el mercado.
